lammpsで計算したMDアニメーションをVMDで表示する

lammps vmd

dumpで指定した出力ファイルがVMDで読み込める。
が読み込み時オプション若しくは拡張子の変更が必要。
dump.filenameを読み込みたい場合、以下のようにする

vmd -lammpstrj dump.filename

もしくはdump.filenameに.lammpstrjを付け加えて、

vmd dump.filename.lammpstrj

ただしatomtypeをVMDのそれと合わせてないと原子の種別があべこべになるので注意。
VMDに読ませた後、原子の種類を変更する方法は後ほど。