mpirun -np 8 lmp_linux -var x 2 -var y 2 -var z 2 こんな感じ。lammpsではユニットセルを分割して並列計算かけるみたいです。つまり上の実行例だと、x,y,z軸に沿って2等分するので8並列の計算になります。多分ですけど。 なので分割数の積がnpの数となる…

やっとlammpsのインストールが終わりました・・・ いろいろ手間取ってしまって、makefileと丸2日ぐらい格闘してました。頭がどうにかなりそう・・・ Centos5.5 on Opteron6128,memory32GBにmpiで実行できるlammpsをインストールしたときにハマッた点をいくつ…