h2oの原子座標
水 - Wikipedia
ぐぐってもなかなか見つからなかったので自分で計算しました。以下メモ。
ボンド長95.84pm、結合角104の水の座標。
酸素の座標を0,0,0とする。
x y z
0.0000000 0.0000000 0
0.7575408 -0.5870796 0
-0.7575408 -0.5870796 0
Rで関数にしてみました。
genh2o<-function(){ h2o<-data.frame() a<-0.9584 alfa<-104.45*pi/180 h2o<-rbind(h2o, cbind(0,0,0), cbind(a*sin(alfa/2),-a*cos(alfa/2),0), cbind(-a*sin(alfa/2),-a*cos(alfa/2),0) ) return(h2o) }